Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud je Ganciclovir kombinován se Zidovudinem. Koncentrace Gancicloviru v séru může být zvýšena, pokud je kombinován s Probenecidem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků může být zvýšeno, pokud je Ganciclovir kombinován s didanosinem. Koncentrace Gancicloviru v séru může být zvýšena, pokud je kombinován s kyselinou mykofenolovou. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud je Ganciclovir kombinován s abakavirem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků může být zvýšeno, pokud je Ganciclovir kombinován se Stavudinem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků lze zvýšit, pokud je Ganciclovir kombinován s Lamivudinem. Koncentrace Tenofovir-dizoproxilu v séru může být zvýšena, pokud je kombinován s Ganciclovirem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků může být zvýšeno, pokud je Ganciclovir kombinován se zalcitabinem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků může být zvýšeno, pokud je Ganciclovir kombinován s Entecavirem. Riziko nebo závažnost nežádoucích účinků se může zvýšit, pokud je Ganciclovir kombinován s emtricitabinem. Riziko nebo závažnost generalizovaných záchvatů lze zvýšit, pokud je Ganciclovir kombinován s Imipenemem.